I sistemi di scaffalature shuttle funzionano utilizzando una configurazione FIFO (first-in, first-out) o una configurazione LIFO (last-in, first-out). Quale verrà utilizzata dipenderà dal fatto che vi sia accesso da entrambe le estremità di un corridoio o da una sola estremità.
Il sistema di scaffalature shuttle viene azionato tramite telecomando, segnale radio o WiFi.
Un operatore umano trasmette semplicemente l'ordine alla navetta, che poi preleva il pallet completo e lo trasporta, tramite binari integrati, al successivo spazio disponibile sullo scaffale. I binari verticali alla fine del corridoio consentono inoltre alla navetta di salire e scendere di livello in modo che non venga sprecato assolutamente spazio.
